Шта су Оказаки фрагменти?



Тхе фрагменти Оказакија они су сегменти ДНК који се синтетизују у заостајућем ланцу током процеса репликације ДНК. Названи су по њиховим проналазачима, Реији Оказаки и Тсунеко Оказаки, који су 1968. године проучавали репликацију ДНК у вирусу који зарази бактерије Есцхерицхиа цоли.

ДНК се састоји од два ланца који формирају двоструку спиралу, која изгледа као спирално степениште. Када се ћелија треба подијелити, она мора направити копију свог генетског материјала. Овај процес копирања генетских информација познат је као репликација ДНК.

Током репликације ДНК, копирају се два ланца који чине двоструку спиралу, једина разлика је у правцу у којем су ови ланци оријентисани. Један од ланаца је у правцу 5 '→ 3', а други у супротном смеру, у правцу 3 '→ 5'..

Већина информација о репликацији ДНК долази из студија проведених са бактеријом Е. цоли и неке његове вирусе.

Међутим, постоји довољно доказа да се закључи да су многи аспекти репликације ДНК слични и код прокариота и код еукариота, укључујући и људе.

Индек

  • 1 Фрагменти Оказакија и репликације ДНК
  • 2 Обука
  • 3 Референце

Фрагменти Оказакија и репликације ДНК

На почетку репликације ДНК, двострука спирала је одвојена ензимом који се зове хелицаза. Хеликаза ДНК је протеин који разбија водикове везе које држе ДНК у структури двоструке спирале, остављајући два лабава ланца.

У двострукој спирали ДНК сваки ланац је оријентисан у супротном смеру. Дакле, ланац има адресу 5 '→ 3', која је природни правац репликације и зато се зове проводни ланац. Други низ има адресу 3 '→ 5', што је обрнути смјер и зове се страи странд.

ДНК полимераза је ензим одговоран за синтезу нових ланаца ДНК, узимајући као калуп два претходно одвојена ланца. Овај ензим ради само у правцу 5 '→ 3'. Према томе, може се синтетисати само један од шаблона шаблона (водећи ланац) континуирано новог ланца ДНК.

Насупрот томе, пошто је заобљени ланац у супротној оријентацији (правац 3 '→ 5'), синтеза његове комплементарне траке се изводи дисконтинуирано. Горе наведено подразумева синтезу ових сегмената генетског материјала који се називају фрагменти Оказакија.

Фрагменти Оказакија су краћи код еукариота него у прокариотима. Међутим, проводне и заостајуће нити реплицирају се континуираним и дисконтинуираним механизмима, односно, у свим организмима.

Траининг

Оказаки фрагменти се формирају из кратког фрагмента РНА названог пример, који је синтетизован ензимом названим примаза. Прајмер се синтетише на ланцу шаблона.

Ензим ДНК полимеразе додаје нуклеотиде у претходно синтетисани РНК прајмер, формирајући на тај начин Оказаки фрагмент. Секвенца РНК је затим уклоњена другим ензимом и затим замењена ДНК.

Коначно, Оказаки фрагменти се везују за растући ланац ДНК кроз активност ензима званог лигаза. Дакле, синтеза заосталог ланца настаје дисконтинуирано због супротне оријентације.

Референце

  1. Албертс, Б., Јохнсон, А., Левис, Ј., Морган, Д., Рафф, М., Робертс, К. & Валтер, П. (2014). Молекуларна биологија ћелије (6. изд.). Гарланд Сциенце.
  2. Берг, Ј., Тимоцзко, Ј., Гатто, Г. & Страиер, Л. (2015). Биоцхемистри (8. изд.). В. Х. Фрееман анд Цомпани.
  3. Бровн, Т. (2006). Геномес 3 (3. изд.). Гарланд Сциенце.
  4. Гриффитхс, А., Весслер, С., Царролл, С. и Доеблеи, Ј. (2015). Увод у генетску анализу (11. изд.). В.Х. Фрееман.
  5. Оказаки, Р., Оказаки, Т., Сакабе, К., Сугимото, К., & Сугино, А. (1968). Механизам раста ДНК ланца. И. Могући дисконтинуитет и неуобичајена секундарна структура новосинтетисаних ланаца. Зборник радова Националне академије наука Сједињених Америчких Држава, 59(2), 598-605.
  6. Снустад, Д. и Симмонс, М. (2011). Принципи генетике (6. изд.). Јохн Вилеи и Сонс.
  7. Воет, Д., Воет, Ј. & Пратт, Ц. (2016). Основе биохемије: Живот на молекуларном нивоу (5. изд.). Вилеи.